Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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