Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms