Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LMBRD1Q9NUN5 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms