Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOMER3Q9NSC5 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms