Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms