Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms