Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NXF3Q9H4D5 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms