Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GPR88Q9GZN0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPR88Q9GZN0 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GPR88Q9GZN0 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPR88Q9GZN0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms