Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CIPCQ9C0C6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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