Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.2 ms