Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SSBP4Q9BWG4 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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