Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UPK3BQ9BT76 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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