Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 AL355388.2-201ENST00000610146 2157 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms