Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GORASP1Q9BQQ3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms