Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms