Protein–RNA interactions for Protein: Q99684

GFI1, Zinc finger protein Gfi-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1Q99684 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFI1Q99684 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms