Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

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Length 2,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH4Q99466 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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