Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBGCP5Q96RT8 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms