Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf72Q96LT7 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms