Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms