Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms