Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHFRQ96EP1 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms