Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SPTSSAQ969W0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SPTSSAQ969W0 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SPTSSAQ969W0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SPTSSAQ969W0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SPTSSAQ969W0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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