Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-CQ95604 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms