Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EDAQ92838 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EDAQ92838 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EDAQ92838 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EDAQ92838 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EDAQ92838 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EDAQ92838 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EDAQ92838 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EDAQ92838 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EDAQ92838 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EDAQ92838 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EDAQ92838 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EDAQ92838 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EDAQ92838 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EDAQ92838 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EDAQ92838 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EDAQ92838 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EDAQ92838 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EDAQ92838 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EDAQ92838 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EDAQ92838 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EDAQ92838 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EDAQ92838 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EDAQ92838 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EDAQ92838 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EDAQ92838 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EDAQ92838 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms