Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD1Q8NHV4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms