Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HDDC3Q8N4P3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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