Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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