Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SMARCD3Q6STE5 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMARCD3Q6STE5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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