Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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