Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms