Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AGAP9Q5VTM2 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms