Protein–RNA interactions for Protein: Q49A88

CCDC14, Coiled-coil domain-containing protein 14, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC14Q49A88 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC14Q49A88 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC14Q49A88 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms