Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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GEN1Q17RS7 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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GEN1Q17RS7 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GEN1Q17RS7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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GEN1Q17RS7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GEN1Q17RS7 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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