Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HADHQ16836 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HADHQ16836 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms