Protein–RNA interactions for Protein: Q16663

CCL15, C-C motif chemokine 15, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL15Q16663 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL15Q16663 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms