Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RPE65Q16518 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RPE65Q16518 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RPE65Q16518 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RPE65Q16518 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RPE65Q16518 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RPE65Q16518 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RPE65Q16518 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RPE65Q16518 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RPE65Q16518 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPE65Q16518 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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