Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F4Q16254 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms