Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 MYH11-202ENST00000396324 6847 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 BTBD9-201ENST00000314100 8486 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ZIK1-202ENST00000536878 4144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 TMPO-212ENST00000556029 4242 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AL592490.1-201ENST00000409186 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 DAAM2-208ENST00000538976 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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VAMP3Q15836 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 MAK16-201ENST00000360128 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 KCNQ3-201ENST00000388996 11510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ELMO1-201ENST00000310758 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 POLR2J4-202ENST00000427076 6466 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 KCNAB1-215ENST00000618897 4437 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 TNS2-210ENST00000549700 4525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 BAHCC1-206ENST00000584436 10801 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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