Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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NCOA1Q15788 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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NCOA1Q15788 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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NCOA1Q15788 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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NCOA1Q15788 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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NCOA1Q15788 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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NCOA1Q15788 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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NCOA1Q15788 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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