Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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PTPRKQ15262 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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PTPRKQ15262 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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PTPRKQ15262 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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PTPRKQ15262 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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PTPRKQ15262 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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PTPRKQ15262 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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PTPRKQ15262 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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PTPRKQ15262 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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PTPRKQ15262 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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PTPRKQ15262 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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PTPRKQ15262 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRKQ15262 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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