Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms