Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCLAFQ15004 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms