Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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COL19A1Q14993 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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COL19A1Q14993 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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