Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms