Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CKAP5Q14008 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CKAP5Q14008 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CKAP5Q14008 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CKAP5Q14008 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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