Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTAN1Q13813 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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