Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NAE1Q13564 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms