Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms