Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 SPATA45-201ENST00000332912 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AL121983.2-201ENST00000426899 688 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 IGFL2-AS1-203ENST00000598518 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 BACH1-AS1-202ENST00000615718 700 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AL513327.1-204ENST00000630229 870 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AL807752.1-201ENST00000395082 1322 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AL355802.1-201ENST00000417591 990 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC015987.1-201ENST00000419211 804 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC018541.1-201ENST00000517706 764 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC005225.3-201ENST00000555972 519 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC018362.2-202ENST00000567089 562 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MKRN4PQ13434 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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